特色博物馆设计可以体现到事物的整体，也可体现到事物的局部，具有内涵和外延的双重性。外延特色，往往是内涵特色的外在表现。而在博物馆这一特定体系内的所谓事物，是指博物馆内涵与外延的各种要素。内涵包括博物馆的区域文化、行业文化和由此形成的博物馆的藏品以及博物馆人形成的博物馆文化。这些内在属性表现为博物馆的外延或外在要素，也就是建筑、管理、陈列、科研、社会教育等等。
特色博物馆与博物馆特色都是关于特色的问题，从词语上表现出特色博物馆中特色是前置词，限定了博物馆的基本属性;而博物馆特色中特色后置于博物馆，体现出特色在博物馆内的局部而非全部。两者的区别不仅仅是词语修饰的问题，从博物馆学和博物馆建设发展的高度也应将两者进行区分。
博物馆学和博物馆建设的各种规范从一般意义上规定了博物馆建设和管理运营的标准，但是这种规范与标准仅仅能使我们建设一个符合标准的博物馆，不能指导使博物馆建设具备个性。中国古代城市特色的形成原因，似乎可供博物馆特色建设参考。古代城市建设过程中首先要遵循一般性要求和制度，比如中国古代的礼制。但是在具体建设一个城市时要遵循自然法则，要因地而异，根据城市所处的自然环境、地势地貌进行对应性设计。
通常在营造博物馆特色时会从区域人文的角度来表达。这是我们的一个惯性的思维，也是相对正确的思维。国内少有的几篇研究博物馆特色的文章也都从理论角度谈了形成博物馆特色的上述几个基本要素。这几年我们在论证、在建设博物馆时也在按照这些基本要素力图使新建的博物馆有自身特色。
博物馆设计水平的高低，不在于馆藏文物的多少，而在于怎样拓展它的文物深度与广度，在于展示它们蕴藏的文化内涵、文化外延和文化渊源，并由它们之间的联系所形成的文化体系。 一般来说，反映地域文化特色的文物藏品和展品，在当地博物馆有较多的收藏，它们处于一种自然的无序的状态，主题蕴藏在里面，看是否有慧眼发掘展示它。主题的确定，要经过反复的提炼，反复的讨论，才能形成。以地域文化特色确定博物馆的主题，是博物馆展示文化个性和研究水平的重要手段。