博物馆设计关系到整个博物馆的迎客流情况，对于展品尤为重要。博物馆设计中更为重要的是要抓好功能分区的设计，因为博物馆中功能设计，占据博物馆设计中很大部分。独具特色的博物馆设计中功能分区有很多种类型，对于不同功能的博物馆起到一定的作用性。
1．嵌入式
博物馆设计中功能分区可以使用嵌入式。嵌入式是指博物馆的办公部分与博物馆的某一层部分连在一起，与整个展区嵌在一起。博物馆设计中功能分区使用嵌入式是因为主展区面积比较小，或是办公区与展区部分联系比较多，才会选择使用嵌入式来设计博物馆。但其实，博物馆设计中功能分区使用嵌入式将给博物馆设计整体结构带来一定难度，毕竟一些办公区域不适宜与展区同一层面。
2．并联式
并联式可以用于博物馆设计中的功能分区里。博物馆的办公部分与展区部分在空间和平面上划分明确，相对独立，自成体系的就是并联式。这类布局有利于办公区和展区的管理与独立使用。由于办公区与展区层高的不同，对博物馆设计带来一定的难度，专业的博物馆设计在采用并联式设计博物馆时，经常会将办公区部分以两层多的高度差来设计。
3．独立式
独立式的博物馆中功能分区设计，就是将独立的办公区和展区独立分开。从外部看博物馆设计，会有两个或几个建筑组团的感觉，并没有什么联系。独立式的设计，一般把办公区与展区之间的空间设计为半通透，与坡道或连廊结合，设置绿地、水景等室外休闲设施。
博物馆设计中功能分区有不同的设计类型，能使整个博物馆展示出不一样的风貌。嵌入式、并联式、独立式的设计，在博物馆设计中功能分区里起到不一般的展示效果。针对不一样的博物馆用途，采用不一样的设计方案，专业的博物馆设计才能起到最佳效果。